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渴望成功-寻找新的方法来处理室内尘螨过敏

的研究人员乐动体育在线和梅努斯大学生物系发表了成功的基因组测序和对欧洲屋尘螨(Dermatophagoides pteronyssinus).

都柏林(上线)

用于新闻稿的HDM室内尘螨是全球室内变应原的重要来源,可加剧哮喘、变应性鼻炎和特应性皮炎。众所周知,它们含有过敏原和蛋白质,可以诱发易感人群的过敏性疾病。先前的研究表明,大约50%的欧洲家庭含有尘螨,大约10%的人口在它们存在时发生过敏反应。现在,研究人员从埃里克西大学生物学系乐动体育在线发表了欧洲屋尘螨的基因组测序和蛋白质组和过敏基因组的调查(Dermatophagoides pteronyssinus).监督的教授肖恩•多伊尔该项目的首席科学家罗斯·沃尔德伦(Rose Waldron)是一名博士生爱尔兰研究委员会企业伙伴计划,及乐动体育在线airmid healthgroup。

与梅诺斯大学的基因组进化实验室合作大卫·菲茨帕特里克博士该团队组装并注释了尘螨的基因组,发现它包含12530个蛋白质编码基因。此外,他们利用强大的计算方法预测,几乎3%的编码蛋白质可能导致人类过敏反应。具体地说,作者证实了37个以前被描述的螨变应原的存在,已知会引起严重的过敏反应。有趣的是,作者还发现尘螨含有1000多个所谓的“孤儿”基因。Fitzpatrick博士解释道:孤儿基因是指那些特定于特定物种的基因,而不是位于其他密切相关物种的基因组中因此,除了含有编码已知过敏原的基因外,欧洲尘螨还含有超过1000个目前尚不清楚具体功能的基因。其中一些孤儿基因本身可能就是重要的过敏原。研究组还开发了新型蛋白质质谱(protein mass spectrometry)方法,对室内灰尘样品中的蛋白质进行检测,结果发现,含有大量与尘螨生长和生存有关的酶等孤儿蛋白质。Natasha Gordon博士乐动体育在线预计,“这些数据可能在开发新的过敏原特异性试验和模拟自然暴露的免疫疗法方面具有临床应用价值airmid对这些发现感到非常兴奋。

利用机器学习和人工智能,作者还在尘螨基因组中发现了有助于脱水生存和允许生物体在环境中生存的基因。研究小组认为,对这些干扰可能代表了一种解决尘螨侵扰的方法,即找到7种抗干燥蛋白。Rose Waldron女士解释道:欧洲室内尘螨含有抗干燥基因的计算预测对我们来说是有趣的,因为它解释了尘螨如何在无水(有限的水)环境中生存。我们研究的真正优势在于,我们可以通过实验证明这些基因被转化为抗性蛋白,从而验证了我们的基因预测。

欧洲尘螨基因组的可用性也使作者能够对不同地理区域尘螨的起源和关系进行进化分析。研究表明,欧洲尘螨与非洲尘螨的亲缘关系更为密切(Euroglyphus maynei),而不是美国的同类(Dermatophagoidesfarinae).他们的论文题目是欧洲家尘螨的蛋白质组和过敏基因组Dermatophagoides pteronyssinus.’可以在同行评议的《公共科学图书馆·综合》杂志上免费获得。质谱仪设备是由爱尔兰科学基金会及由DJEI/DES/SFI/HEA爱尔兰高端计算中心(ICHEC).

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